L'église Saint-François-Xavier a été construite en 1684 à la demande des Jésuites, sur un projet de l'architecte Angelo Italia. La construction a été achevée en 1710 et le 24 novembre 1711, elle a été consacrée au culte par Bartolo Castelli de Palerme, évêque de Mazara del Vallo. L'église, autre exemple de baroque en Sicile, est située dans le quartier d'Albergheria. L'extérieur comporte un grand dôme central et quatre dômes plus petits, ainsi qu'un clocher du même style architectural. La façade est divisée en deux ordres : au centre, le portail du XVIIIe siècle, sur les côtés, deux colonnes torsadées supportant autant de volutes et dans la coquille, une représentation de saint François Xavier avec un lys et un cœur ouvert, couronné par deux putti. Sous le buste du saint se trouve un crabe tenant une croix. Selon une légende, François Xavier aurait un jour perdu son crucifix dans une rivière et un crabe le lui aurait rapporté. Dans le deuxième ordre de la façade, seule la partie centrale s'élève avec deux colonnes supportant le tympan. À l'intérieur, une inscription en marbre indique : Dedi te in lucem gentium, "Je t'ai établi comme la lumière des nations". L'expression est tirée du livre d'Isaïe et fait référence à Jésus-Christ, mais aussi, dans ce cas, à saint François Xavier, en souvenir de son œuvre évangélisatrice. L'intérieur de l'église est accessible par sept marches, en référence aux sept jours de la création du monde. L'édifice présente un plan en croix grecque et six chapelles plus petites, dont l'une est dédiée à Santa Rosalia, patronne de Palerme, et une autre à St Ignace de Loyola. Il y a 24 colonnes au total, symbolisant les 12 tribus de l'Ancien Testament et les 12 apôtres du Nouveau Testament. Ils font également allusion aux 24 anciens de l'Apocalypse. Dans l'espace central se trouve une grande et haute coupole reposant sur quatre pendentifs et représentant des scènes de la vie de Saint François Xavier.