L'Església de S. Stefano es troba en Garlate, un bonic poble medieval amb vista a una branca del Llac de Lecco. L'edifici que podem veure avui en dia a l'alta, dóna testimoni de fet, ja en solitari, amb les estructures romàniques supervivents, el barroc capelles, i en el segle xix, les vicissituds d'un llarg i convuls de la història, però només les excavacions a sota de la planta de l'església actual han permès una més antiga passat que abans només era possible per a especular. De fet, moltes pistes, com ara el descobriment en el segle xix, diversos reliquaries tardoantichi sota l'altar, i la presència d'elements arquitectònics i erràtica, que és igualment relacionats amb un edifici de principis cristians període, ha permès entendre l'antiguitat de la religió cristiana en aquest lloc, encara que no tenia la certesa que l'església de Sant Esteve de ser considerat com a l'hereu d'aquell llarg de la història. De fet, fins a finals del segle XVI, en les proximitats de l'actual edifici es va situar bé a altres dues esglésies, la col·legiata de Santa Agnès i l'oratori de S. Vincenzo, que tots dos van ser considerats irrecuperables per a la seva edat, i condemnat a l'enderroc a la iniciativa del cardenal Carlo Borromeo, que va fer una visita pastoral a la zona en 1565. Fou en aquesta ocasió que l'antic reliquaries, entre els quals un preciós plata cas del quart de segle, es van retirar de l'altar de l'Església de S. Agnes i es va traslladar a l'Església Parroquial de S. Stefano, a partir d'aquell moment l'única construcció religiosa de l'esquerra en el poble.