In Modica wurden neben den künstlichen Grotten für Wohnzwecke auch Orte für die cura animarum geschaffen, die zahlreichen Rupertikirchen, die noch heute in den städtischen und außerstädtischen Gebieten zu finden sind. Im Herzen des historischen Zentrums, in der Via Grimaldi, befindet sich die San Nicolò gewidmete Kirche. Sie wurde zwischen dem 11. und 12. Jahrhundert erbaut, als die Insel mit der normannischen Eroberung zum Christentum zurückkehrte, und stellt eine der wichtigsten negativen religiösen Architekturen im Südosten Siziliens dar. Wahrscheinlich war sie die Pfarrkirche des griechischsprachigen Viertels von Modica, in der anfangs der östliche Ritus praktiziert wurde, der im Zuge der Latinisierung nach und nach aufgegeben wurde. Im Jahr 1577 wurde die Kirche San Nicolò der nahe gelegenen und wichtigeren Pfarrei San Pietro angegliedert.
