Museoak fisikako eta astronomiako tresna zientifikoak ditu bere baitan, Eta Bereziki Antonio Bakinottik Pisa-k egindako asmakizunak gordetzen ditu, makina ospetsutik hasita, gaur egungo Dinamo-motor zuzenenetik, trakzio elektromagnetikorako gailuraino: bakinotti Fondoaren parte diren asmakizun guztiak. Taldea oso aberatsa eta heterogeneoa da. Bildumaren zatiak motaren arabera banatuta daude: Mekanika, Astronomia, elektromagnetismoa, denboraren neurketa, optika, akustika, makina-erreminta.
Museoko bildumak artxibategi garrantzitsuez osatzen dira, Hala nola, Unibertsitateko liburutegi sistemak kontserbatutako Bakinotti funtsaren zati dokumentala, Bakinotti Artxiboa, Fermin-Persiko Artxiboa eta Rikardo Feliziko Artxiboa.
Fisika tresnen Museoa antzoki zientifikoarekin elkarlanean ari da: Galileako espiritu batekin, Zientziaren eta zientzialarien historia egin duten esperimentuak erreproduzitzea du helburu Erakusketa interaktibo eta didaktikoak. Bertan, jolasten eta ondo pasatzen duten haurrek, nerabeek eta helduek zientzia ezagutzen eta ulertzen ikasten dute. Antolatutako ekitaldiak jokoak Moderna esperimentuak gai zirraragarrienetara eta fisika klasikoa eta modernoaren alderdiak aurkezten duten bideak dira, Galileo Etatik Einstein Segundoaren berrikuntzak
