Chlubą wnętrza chrzcielnicy jest chrzcielnica, wspaniałe dzieło z marmuru, brązu i emalii, do którego przyczynili się najwięksi rzeźbiarze epoki, w tym Giovanni di Turino, Lorenzo Ghiberti, Donatello i Jacopo della Quercia w latach 1417-1431. Chrzcielnica składa się z sześciokątnej miseczki ozdobionej sześcioma złoconymi płytami z brązu przedstawiającymi sceny z życia św. Jana Chrzciciela na przemian z posągami cnót, z których dwa – wiara i nadzieja – są autorstwa Donatello. Do najbardziej reprezentatywnych scen należą odlany w 1427 r.Chrzest Chrystusa Lorenzo Ghibertiego, elegancka i wyrafinowana scena o malarskiej jakości i poczuciu perspektywy, osiągnięta dzięki zastosowaniu przez niego techniki reliefu "stiacciato" (bardzo płaskiej, niskiej). Cykl dopełnia słynny relief odlany przez Donatello w 1427 roku przedstawiający Święto Heroda, najbardziej poruszającą scenę ze wszystkich, zarówno ze względu na dramatyczny charakter tematu, jak i wspaniałe walory formalne panelu.
