Fort Saint-Jean är en befästning i Marseille som byggdes 1660 av Ludvig XIV vid ingången till den gamla hamnen i Marseille. Platsen för Fort Saint-Jean har varit ockuperad sedan antiken men det var inte förrän på 1200-talet som riddarna av Saint-John (senare riddarna av Malta) etablerade sig här och uppkallade området efter dem. Några reliker finns fortfarande kvar. Det enorma fyrkantiga tornet byggdes på fundamenten av Maubert-tornet för att försvara hamninloppet efter den aragonesiska plundringen (1423) av Roy René. Fyrtornet byggdes 1644 och Chevalier de Clerville byggde fortet på order av Ludvig XIV i hans stora planer för Marseille. Han lät gräva ut ett hål som kunde översvämmas för att isolera fortet från staden. Det användes som garnison och sedan som fängelse under franska revolutionen. Under andra världskriget användes det för att lagra den tyska arméns ammunition som exploderade 1944 och orsakade stora skador på fortet och transportbron. Fortet listades som Monument Historique 1964 och inkluderades i MuCEM 2013.