Fort Saint-Jean is een fortificatie in Marseille, gebouwd in 1660 door Lodewijk XIV bij de ingang van de Oude Haven van Marseille. De site van Fort Saint-Jean wordt al sinds de Oudheid bewoond, maar pas in de 13e eeuw vestigden de Ridders van Saint-Jean (later de Ridders van Malta) zich hier en noemden het gebied naar hen. Enkele overblijfselen zijn bewaard gebleven. De enorme vierkante toren werd gebouwd op de fundamenten van de Maubertoren om de haveningang te verdedigen na de Aragonese plundering (1423) door Roy René. De baken toren werd gebouwd in 1644 en de Chevalier de Clerville bouwde het fort op bevel van Lodewijk XIV in zijn grote plannen voor Marseille. Hij liet een overstromingsgevaarlijk gat graven om het fort te isoleren van de stad. Tijdens de Franse Revolutie werd het gebruikt als garnizoen en vervolgens als gevangenis. Tijdens de Tweede Wereldoorlog werd het gebruikt om de munitie van het Duitse leger op te slaan, die in 1944 explodeerde en grote schade toebracht aan het fort en de Transportbrug. Het fort werd in 1964 geklasseerd als Historisch Monument en in 2013 opgenomen in het MuCEM.