Fortifikimi i parë në këtë sit ishte një kullë me një bazë katërkëndëshe, e ndërtuar midis 1583 dhe 1585 nga arkitekti Fiorentin Camillo Camillani me urdhër Të Marcantonio II Colonna I Riu, Mëkëmbës i Sicilisë, si pjesë e një plani mbrojtës të bregdetit Sicilian. Ndërtimi i fortesës së tanishme filloi në 1615 nga Hernando Petigno, gjeneral komandues i Kalorësisë Mbretërore të Siçilisë dhe Guvernator Ushtarak I Sirakuzës. Kulla e vjetër u përfshi në fortesën e re. Ndërtimi u ndërpre deri në vitin 1636 kur punimet rifilluan nën drejtimin E Serpione Cottone, Markez D'altamura. Fortesa u përfundua dhe u hap në 1640 dhe është një shembull i rrallë i një kështjelle barok nga e cila disa u ngritën në Sicili në shekullin e 17-të. Fort Sant'angelo nuk u sulmua kurrë dhe u demilitarizua në shekullin e 19-të kur u përdor si vend për një telegraf qeveritar nga 1849 deri në 1856. Në fillim të viteve 1900 fortesa u garnizonua nga Forcat Ajrore dhe fortesa u bë një far. Në mëngjesin e 10 korrikut 1943 E ashtuquajtura Dita D Për zbarkimin Anglo-Amerikan në Sicili, Fort Sant'angelo u bombardua nga kryqëzori amerikan I dritës USS Brooklyn dhe shkatërruesi USS Buck. Kjo shkaktoi shumë dëme të cilat u riparuan të gjitha më vonë. Në vitin 1965, operacioni i farit u anulua dhe fortesa u braktis.
