Wewnątrz Intramuros, "otoczone murami miasta" znajduje się XV-wieczna twierdza, którą jest Fort Santiago. Jest to prawdopodobnie najbardziej zabytkowa atrakcja miasta dzisiaj. Jose Rizal został uwięziony i stracony tutaj.Fort został nazwany na cześć świętego Jakuba (Santiago po hiszpańsku), patrona Hiszpanii, który jest również znany jako Święty Jakub Pogromca muzułmanów ze względu na legendę, że cudownie pojawił się setki lat po śmierci, aby walczyć w bitwie pod Clavijo, którego relief zdobi fasadę frontu gate.It znajduje się u ujścia rzeki Pasig i służył jako główna twierdza obronna rządu hiszpańskiego podczas ich rządów w kraju. Stał się głównym fortem handlu przyprawami do obu Ameryk i Europy przez 333 lata. Handel Galeonem z Manili do Acapulco w Meksyku rozpoczął się od Fuerte de Santiago. Fort ma obwód 2030 stóp (620 m) i ma prawie trójkątny kształt.