Fraser Island blev optaget på UNESCO's liste over verdensarv i 1992 som en anerkendelse af dens naturværdier.
Den officielle henvisning hylder øens "" og henviser til "over 250 km sandstrande med lange, uafbrudte strande, med mere end 40 km markant farvede sandklipper samt spektakulære klitudspring og surfstrande"; høje regnskove, der vokser på sand med lavt næringsindhold, klitsøer på klitterne, herunder både klare "hvidvandssøer" og mørke "sortvandssøer", banksia-skove, heder, mønstrede sumpede moser og beskyttede mangroveområder i et spektakulært "mosaiklandskab"."
Fraser Island er et globalt betydningsfuldt eksempel på geologiske processer og biologisk udvikling, herunder: komplekse kystklitformationer, der stadig er under udvikling; en række søer, der er enestående med hensyn til antal, mangfoldighed, alder og beviser på dynamiske og udviklingsmæssige stadier; og fremragende eksempler på økosystemer, der har udviklet sig som reaktion på maritime forhold og dårlig jordbund i kystklitformationer.
Hele øen er en del af Great Sandy National Park (bortset fra områder med fri ejendom som f.eks. byområder) og er beskyttet i henhold til Nature Conservation Act 1992 og Recreation Areas Management Act 2006 indtil lavvandslinjen.