Klosterkirche blev grundlagt i 1250 i den tidlige gotiske stil som en klosterkirke for et franciskansk hus. Det var en feltstenskirke, 52 meter lang og 16 meter bred. Dens rester kan findes i den nordlige mur af de nuværende ruiner. Dette blev erstattet med en basilikakirke med tre gange, begyndt i slutningen af det 13.århundrede og afsluttet i første halvdel af det 14. århundrede, hvis ruiner stadig overlever. I 1365 Louis II, kurfyrsten af Brandenburg blev begravet der. Omkring 1500 blev det renoveret.
Klosteret blev lukket på grund af den protestantiske Reformations ankomst til Berlin i 1539. Ingen af klosterbygningerne overlever, selvom nogle af dem husede Berlins første trykpresse fra 1571 og Evangelisches Gymnasium til Grauen Kloster fra 1574. Elever og lærere på sidstnævnte omfattede Karl Friedrich Schinkel og Friedrich Ludvig Jahn, mens Otto von Bismarck også besøgte kirken. Leonhard Thurneysser ledede trykpressen og restaurerede også kirken mellem 1583 og 1584.
Små ændringer blev foretaget i anden halvdel af det 17.århundrede, såsom nedrivning af det gamle trappetårn, opførelse af en ny trætrappe på vestsiden og i 1712 nedrivning af rood-skærmen, der adskiller skibet fra koret. 1712 så også en brand i kirkens tag, og i 1719 blev kirken restaureret, hævede gulvniveauet med 1 meter og murede to nordlige korvinduer op.
Omfattende renoveringer blev gennemført i første halvdel af det 19.århundrede - gavletårnet blev revet ned i 1826, to nye tårne blev bygget på vestsiden i 1842, et nyt sakristi blev bygget og gulvet sænket igen. Der blev udarbejdet planer for arbejdet af Karl Friedrich Schinkel, Christian Gottlieb Cantian og den tidligere sporinspektør Berger blev forud for byggearbejdet-Bergers andet design var det, der i sidste ende blev implementeret. Arbejdet varede indtil 1845, skønt kirken blev lukket på grund af alvorlig fugt i murværket i 1902, og i 1926 blev de fleste ændringer i det 19.århundrede vendt. Kirken blev genindviet den 24. maj 1936.
Kirken blev ødelagt den 3. April 1945 i bombningen af Berlin i Anden Verdenskrig.i 1950 blev affaldet fjernet, og kirkeruinerne blev sikret mellem 1959 og 1963, skønt de ødelagte klosterbygninger blev revet helt ned for at give plads til en park. Ruinerne blev restaureret igen i 2003-2004 og bruges nu til udstillinger, skuespil og koncerter.
Reference: Danfoss
