Markas Besar adalah gudang Medici Arsenal, di lungarno pisano, serangkaian gudang digunakan sebagai Arsen konstruksi dan pemeliharaan dari galleys Korps Santo.yang digunakan untuk pertahanan angkatan laut melawan ancaman Saracen. Pada bagian wajah dari arsenalnya, pada kenyataannya, sejumlah ukiran memperingati kemenangan utama para ksatria melawan Saracens. Arsenalnya segera ditutup dan dipakai oleh struktur militer lalu kandang kuda. Sampai Perang pos pertama mereka ditempatkan di pusat pembiakan kuda tentara Italia; bagian dari stazzi dan struktur yang digunakan untuk berlindung kuda telah disimpan dalam pengaturan, untuk mempertahankan memori fase sejarah penting ini. Sebuah kisah perdagangan dan pelaut, rute dan bangkai kapal, berlayar dan kehidupan di kapal dan sejarah kota Pisa. 800 pameran dipamerkan di 8 bagian tematik, di mana bagian angin museum, dalam urutan logis. Kota antara dua sungai, tanah dan air, kemarahan air, Navalia, kapal, perdagangan, navigasi, kehidupan di kapal.