Grav St. Clare ritades och ville utanför porta urbica, i kyrkan San Giorgio, där Francis var redan tillfälligt begravd och där helgonet begravdes den 12 augusti 1253. Kyrkan San Giorgio var strax utanför den homonyma porten i staden, lite lägre än den väg som, lämnar staden, ledde "kontra Ispellum"; en annan väg gick upp till san Rufino, och en tredjedel, längs den romerska muren, ned mot porta Moiano. Därför kallades platsen "Tribium S. Georgii". Mellan vägen och kyrkan stod, inte så länge sedan, ett sjukhus som bifogades kyrkan; allt berodde på katedralens kapitel.
Medan för kyrkan-mausoleum, som skall uppföras för att hedra St Francis, platsen bestämdes endast två år efter hans död, för den som ska tillägnas St Clare vi omedelbart orienterade mot den motsatta delen av staden, precis bredvid kyrkan St George (Marino Bigaroni, Basilikan St Clare i Assisi, s.13). Tre år efter döden och ett år efter kanoniseringen av St Clare började i 1257 byggandet av basilikan St Clare runt den gamla kyrkan St George, som fram till 1230 hade hållit de dödliga resterna av St Francis. Resterna av helgen flyttades redan 1260, medan den högtidliga invigningen ägde rum 1265, i närvaro av Clement IV.byggnadsarbetet utfördes av arkitekten Filippo Da Campello. Kryptan som nu inrymmer helgonens grav byggdes endast 1850.