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El castillo veneciano de Querini fue fundado por Giovanni Querini, un funcionario veneciano del Ducado de Naxos, en 1413. En ese momento la isla había sido desolada debido a las consecutivas incursiones piratas. El castillo fue construido utilizando rocas ferrosas locales en la posición en la que la antigua acrópolis de la isla una vez se encontraba reviviendo el pueblo y asegurando su supervivencia contra potenciales invasores. La arquitectura del castillo lo hace muy impresionante aún hoy en día. Sólo tiene una entrada en su lado suroeste, que es un pasadizo bajo abovedado. El muro circundante del castillo se apoyaba en varios puntos sobre muros de casas reforzadas. Estos se llamaban "xokastra" y formaban un anillo protector como una segunda línea de defensa a su alrededor. Algunos todavía existen hoy en día y han comenzado a ser renovados. La mayoría de las casas dentro del castillo se han derrumbado debido a un terremoto que golpeó la isla en 1956. Una torre llamada "Saray" todavía se mantiene en pie en el extremo sur del castillo y dos iglesias con paredes encaladas siguen destacando entre los muros de piedra gris. La primera, cerca de la entrada, llamada Panagia Castriani, fue construida en 1853 y dedicada a la Anunciación a la Santísima Virgen María. Para su construcción se utilizó material de las casas de la familia Querini. Más adentro, está la iglesia de Agios Georgios que fue construida en 1790. El espacio abierto frente a ella solía ser la "platsa", es decir, la plaza central donde se realizaban las reuniones del pueblo.
