Klosteret i Vallingegno ligger på toppen af en bakke et par miles fra Gubbio, nedfældet i den smukke natur i det umbriske landskab. Den nøjagtige dato for dens grundlæggelse er ukendt, men klosteret nævnes i "Legenda Sancti Verecundi", der stammer fra det 7.århundrede og fortæller om martyrdøden for en ung ridder, der konverterede til den kristne tro.
Klosteret, der muligvis opstod som et tempel for den hedenske gud Genio-deraf det latinske navn Vallis Genii-blev besat af benediktinske munke i næsten fire århundreder, og forblev et blomstrende centrum indtil tidspunktet for dens undertrykkelse, omkring 1442.
Det nuværende kompleks består af kirken, klosteret og en murværk klokkegabel.
Det indre af single-nave-kirken bevarer stadig spor af de foregående strukturer, især i den firkantede krypt, der indeholder nogle søjlehovedstæder, der er skulptureret efter stilarter, der stammer fra før det 11.århundrede. Kryptens lyskehvelvloft er forstærket af en central søjle. Mange episoder fra Saint Francis liv er forbundet med klosteret. Helgens biografer fortæller for eksempel, hvordan Francis søgte tilflugt her efter at være blevet angrebet i nærheden af Caprignone; prioren modtog ham imidlertid ikke godt, og helgen blev tiltalt for ringe husholdningsopgaver. År senere, klosterets forudgående gik tilbage til Francis for at bede om hans tilgivelse;