Het unieke museum is gewijd aan de 6000-jarige geschiedenis van brood als onmisbare basis van de menselijke cultuur en beschaving. Het dankt zijn oprichting en groei aan de decennialange persoonlijke inzet van Willy Eiselen (1896-1981) en zijn zoon Hermann Eiselen (geboren in 1926). Beiden hielden zich bezig met de productie en verkoop van bakkerijgrondstoffen en behoorden tot de belangrijkste leveranciers van de bakkerijhandel.
De twee ondernemers richtten in 1955 als vereniging het museum op als Duits Broodmuseum. De eerste permanente tentoonstelling dateert van 1960. Het was het eerste en vele jaren het enige museum in zijn soort ter wereld. Het was een strikt particuliere instelling die door de oprichters werd gefinancierd. In 1991 werd de financiering van het museum overgenomen door de Eiselen Stichting, een onafhankelijke liefdadigheidsinstelling; tegelijkertijd verhuisde het museum naar het Salzstadel, een historisch pakhuis in het centrum van Ulm.
Hier floreerde het museum en in 2004 ontving het zijn miljoenste bezoeker.
