Hong Kong Muzeju Istorije je osnovana u julu 1975 kada Grad Muzej i Umjetničke Galerije je podijeljen u Hong Kongu Muzeju Istorije i Hong Kong Muzej Umetnosti. Međutim, neke od muzejskih zbirki datiraju još iz Gradske muzejske i umjetničke galerije osnovane 1962.u Gradskoj Vijećnici. 1983. Muzej je premješten u privremeni smještaj u Kowloon parku. Premješten je u sadašnje prostorije Chatham Road South, Tsim Sha Tsui 1998. godine. Stalne kući Hong Kong Muzeju Istorije, s odvratno površina od 17,500 m2, je smještena u novu zgradu na osnovu arhitektonski koncept G E. Verner Johnson. Novi muzej i susjedni muzej zajedno formiraju muzejski kompleks skladnog izgleda i šeme boja.