Hongkongi Ajaloo Muuseum loodi 1975. aasta juulis, kui Linnamuuseum ja kunstigalerii jagunesid Hongkongi ajaloo muuseumiks ja Hongkongi kunstimuuseumiks. Kuid mõned muuseumi kogud pärinevad linnamuuseumist ja kunstigaleriist, mis asutati 1962. aastal Raekojas. 1983. aastal viidi Muuseum Kowlooni pargi ajutisse majutusse. See viidi oma praegustesse ruumidesse Chatham Road South, Tsim Sha Tsui 1998.aastal. Hongkongi ajaloo muuseumi alaline kodu, mille brutopõrandapind on 17 500 m2, asub uues hoones, mis põhineb hr E. Verner Johnsoni arhitektuurilisel kontseptsioonil. Uus muuseum ja naabruses asuv teadusmuuseum moodustavad koos harmoonilise välimuse ja värvilahendusega muuseumikompleksi.