Muzej zgodovine v Hong Kongu je bil ustanovljen julija 1975, ko je bil Mestni muzej in Galerija razdeljena v Hongkonški Muzej zgodovine in Hongkonški Muzej umetnosti. Nekatere muzejske zbirke pa so iz muzeja in galerije, ustanovljene leta 1962 v Mestni hiši. Leta 1983 so Muzej preselili v začasno nastanitev v Kowloon parku. Prestavljen je bil v svoje sedanje prostore na Chatham Road South, Tsim Sha Tsui leta 1998. Stalni dom Hong Kong Muzej Zgodovine, z bruto tlorisno površino, 17,500 m2, se nahaja v novo stavbo, ki temelji na arhitekturni koncept G. E. Verner Johnson. Novi muzej in sosednji Muzej znanosti skupaj tvorita muzejski kompleks harmoničnega videza in barvnega sistema.
