V súčasnosti sa Mestské múzeum v Brne radí medzi špičkové múzeá v krajine a nachádza sa v niekoľkých historických, ikonických budovách mesta: hrad Špilberk, M .nínská brána a vila Tugendhat. Špilberk je ústrednou polohou, v ktorej sídli správa múzea, knižnice, fotoarchív a väčšina špecializovaných zamestnancov. Areál hradu slú i ako depozitár a miesto pre stále expozície, ako aj otheralšie prehliadky súvisiace najmä s históriou a kultúrou Brna. Mestské múzeum v Brne spravuje aj vilu Tugendhat, ktorá je významným príkladom modernej architektúry zaradenej do Zoznamu svetového dedičstva UNESCO.