En 1678 el Consejo del Reino de Aragón decide erigir un templo en honor a Santa Isabel de Portugal. Tras llegar a un acuerdo con los padres Teatinos (o Cayetanos, de ahí su otro nombre), en 1681 se inician las obras en el solar que éstos han reservado para su convento. Santa Isabel, infanta de Aragón, hija de Pedro II y casada con el rey Dionisio de Portugal, había sido canonizada en 1625 y su culto pronto arraigó en toda la región.
La tipología de esta iglesia, en cuanto a planta y distribución interior, sigue el modelo de san Cayetano en Madrid. Éste, a su vez, repite modelos de Roma, de ahí la relación siempre mencionada entre el barroco italiano y el templo zaragozano.
La fachada monumental es excepcional por su riqueza y profusión decorativa. Las airosas torres delimitan una estructura vignolesca disimulada por la suntuosa ornamentación, su colorida decoración, de estilo churrigueresco, es única en nuestra ciudad.
Se buscan efectos cromáticos con el uso de diferentes materiales: piedra negra para los elementos arquitectónicos, piedra ocre para los elementos decorativos y alabastro blanco para el fondo de los paneles. El escudo heráldico de Aragón preside la entrada, flanqueado por las estatuas de San Andrés Avelino y San Cayetano. En la hornacina superior se sitúa la Santa Isabel, representada, según la tradición, con el manto entreabierto para que se vean algunas rosas.
En el interior destaca el original conjunto de cúpulas -precedente del sistema de techos de la basílica del Pilar- y el retablo mayor, uno de los más elegantes del barroco tardío zaragozano, con obra de José Ramírez de Arellano. Del retablo procede la estatua ecuestre de San Jorge que hoy se encuentra en el vestíbulo de la Diputación Provincial de Zaragoza.
Los zaragozanos conocen esta iglesia sobre todo por su actividad en Semana Santa. De esta iglesia sale la procesión del Santo Entierro, ya que la Real Hermandad de la Sangre de Cristo guarda en su interior la devota imagen del Cristo de la Cama.
