L'île de Caprera est entièrement incluse dans le parc national de l'Arcipelago di La Maddalena, une zone marine et terrestre protégée d'intérêt national et communautaire. Elle possède un littoral découpé et accidenté. La partie orientale de la côte est particulièrement difficile à atteindre car elle est protégée par une petite chaîne de granit rose. La zone côtière du côté est est très escarpée, couverte en partie de genévriers, de lentisques et d'une autre végétation méditerranéenne typique. Vers l'ouest, la pente laisse place à des étendues plates de maquis méditerranéen et à une grande forêt de pins. La nature sauvage et intacte de l'île lui a valu d'être déclarée réserve naturelle en 1982, puis d'être intégrée au parc national de La Maddalena. En raison de sa valeur naturelle et environnementale particulière, la majeure partie de la partie orientale du littoral, appelée zone A, est soumise à un régime de protection totale qui interdit la pratique de la pêche en face de Cala Coticcio. Cette interdiction s'applique également à la zone marine située à l'est de Punta Rossa et d'Isola Pecora. En hiver, la zone peut encore être explorée en voiture, mais en été, il est interdit de la traverser sans une autorisation accordée par la municipalité et l'autorité du parc. L'île de Caprera, en plus de sa beauté naturelle, est connue parce qu'elle conserve la mémoire des vingt-six années que Giuseppe Garibaldi décida d'y passer : visitez le recueil Garibaldi avec la tombe et la Casa Bianca, sa résidence jusqu'à sa mort. L'île abrite également une école de voile : le centre de voile de Caprera.