A ilha de Caprera está inteiramente incluída no arquipélago do Parque Nacional La Maddalena, uma área marinha e terrestre protegida de interesse nacional e comunitário. Tem um padrão costeiro irregular e agitado. A parte oriental da costa é particularmente difícil de alcançar porque é protegida por uma pequena cadeia de granito rosa. A área costeira do lado leste é muito íngreme, coberta em parte por Zimbros, mastique e outros espécimes típicos dos maquis mediterrâneos. A oeste, a encosta dá lugar a extensões planas, também de maquis mediterrâneos, onde também há uma vasta floresta de pinheiros. A natureza selvagem e Imaculada da ilha determinou, em 1982, a declaração de uma Reserva Natural, seguida de sua inclusão no Parque Nacional La Maddalena. O valor naturalista e ambiental particular significou que a maior parte do trecho costeiro Oriental, a chamada Zona A, está sob um regime de proteção integral que proíbe a prática da pesca em frente a Cala Coticcio. Esta proibição também se aplica à área marinha a leste de Punta Rossa e Isola Pecora. No inverno, a área ainda pode ser explorada de carro, mas no verão é proibido passar por lá, a menos que com uma autorização concedida pelo município e pela Autoridade do Parque. A ilha de Caprera, bem como por suas belezas naturais, é conhecida porque preserva a memória dos vinte e seis anos que Giuseppe Garibaldi decidiu passar lá: visitar o compêndio de Garibaldi com o túmulo e a Casa Branca, sua residência até sua morte. A ilha também abriga uma escola de vela: o caprera Sailing Center.
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