Insula Caprera este inclusă în întregime în arhipelagul Parcului Național La Maddalena, o zonă protejată marină și terestră de interes național și comunitar. Are un model de coastă zimțat și agitat. Partea estică a coastei este deosebit de dificil de atins, deoarece este protejată de un mic lanț de granit roz. Zona de coastă din partea estică este foarte abruptă, acoperită parțial de ienuperi, copaci Mastici și alte exemplare tipice ale Maquisului mediteranean. Spre vest, versantul dă loc unor întinderi plate, de asemenea, de maquis mediteranean, unde există și o vastă pădure de pini. Natura sălbatică și imaculată a insulei a determinat, în 1982, declararea unei rezervații naturale, urmată de includerea acesteia în Parcul Național La Maddalena. Valoarea naturalistă și de mediu deosebită a însemnat că cea mai mare parte a întinderii de coastă din est, așa-numita zonă a, se află sub un regim integral de protecție care interzice practicarea pescuitului în fața Cala Coticcio. Această interdicție se aplică și zonei marine de la est de Punta Rossa și Isola Pecora. Iarna, zona poate fi explorată în continuare cu mașina, dar vara este interzisă trecerea acolo, cu excepția cazului în care există o autorizație acordată de municipalitate și autoritatea Parcului. Insula Caprera, precum și pentru frumusețile sale naturale, este cunoscută pentru că păstrează amintirea celor douăzeci și șase de ani pe care Giuseppe Garibaldi a decis să-i petreacă acolo: să viziteze Compendiul Garibaldi cu mormântul și Casa Albă, reședința sa până la moartea sa. Insula găzduiește, de asemenea, o școală de navigație: Centrul de navigație caprera.
