La isla de Caprera está incluida en su totalidad en el Parque Nacional del Arcipelago di La Maddalena, una zona marina y terrestre protegida de interés nacional y comunitario. Tiene un litoral abrupto y accidentado. La parte oriental de la costa es especialmente difícil de alcanzar porque está protegida por una pequeña cadena de granito rosa. La zona costera del lado oriental es muy escarpada, cubierta en parte por enebros, lentiscos y otra vegetación típica del Mediterráneo. Hacia el oeste, la ladera da paso a extensiones planas de maquis mediterráneo y a un gran pinar. La naturaleza salvaje y virgen de la isla hizo que fuera declarada Reserva Natural en 1982, y posteriormente incluida en el Parque Nacional de La Maddalena. El especial valor natural y medioambiental de la isla ha hecho que la mayor parte del tramo de costa oriental, conocido como Zona A, esté bajo un régimen de protección total que prohíbe la pesca frente a Cala Coticcio. Esta prohibición también se aplica a la zona marina al este de Punta Rossa e Isola Pecora. En invierno, la zona se puede recorrer en coche, pero en verano está prohibido pasar por ella sin una autorización concedida por el Ayuntamiento y la Autoridad del Parque. La isla de Caprera, además de por su belleza natural, es conocida por conservar el recuerdo de los veintiséis años que Giuseppe Garibaldi decidió pasar allí: visite el Compendio Garibaldi con la tumba y la Casa Bianca, su residencia hasta su muerte. La isla también alberga una escuela de vela: el centro náutico de Caprera.