Menginap di ibukota Malta tidak lengkap tanpa mengunjungi Katedral Bersama St John Malta. Proyek ini ditugaskan pada tahun 1572 oleh Grand Master Jean de la Cassiere untuk menjadi gereja bagi Ordo Ksatria St John, dan dirancang oleh arsitek Malta, Gerolamo Cassar. Pekerjaan ini selesai pada tahun 1577 dan didedikasikan untuk Santo Yohanes Pembaptis, salah satu dari dua santo pelindung Ordo ini. Katedral Santo Yohanes di Valletta menunjukkan pentingnya agama Kristen bagi negara Malta. Dari luar, katedral abad ke-16 ini mungkin tidak terlihat banyak, tetapi intiplah ke dalam dan Anda akan terkejut. Katedral ini direnovasi pada abad ke-17 dan memiliki dekorasi Barok yang mewah. Selain kaya akan seni dan peninggalan Barok, Katedral Co juga memiliki lukisan dinding Barok yang mengesankan, lantai marmer berornamen, patung tiga dimensi, dinding batu berukir, dan langit-langit berkubah yang menakjubkan yang didekorasi oleh seniman Barok Italia yang terkenal, Mattia Preti. Katedral ini juga merupakan rumah bagi salah satu karya Michelangelo Merisi da Caravaggio yang paling dikenal secara internasional, yang dikenal dengan "Pemenggalan Kepala Yohanes Pembaptis" (1608). Lukisan yang terletak di dalam Oratory ini merupakan karya seni terbesar dari Caravaggio dan satu-satunya yang memiliki tanda tangannya. Setiap hari sepanjang tahun, pengunjung datang ke katedral untuk melihat sekilas karya seni yang terkenal ini, dan banyak yang akan kembali ke katedral ini setiap kali mereka berada di pulau ini. Katedral itu sendiri terdiri dari sembilan kapel yang didekorasi dengan indah di kedua sisinya; delapan kapel dibangun untuk masing-masing bahasa Ksatria St Yohanes, dan kapel kesembilan didedikasikan untuk santo pelindung mereka, Bunda Maria dari Philermos, santo pelindung lainnya dari Ordo ini. Kapel terakhir juga merupakan rumah bagi ikon kuno Bunda Philermos, yang oleh para Ksatria dianggap sebagai benda suci. Katedral Bersama St John di Malta juga memiliki ruang bawah tanah misterius yang berisi makam para Grand Master Ksatria St John di masa lalu.