Höjden där Santanders katedralkyrka ligger utgör de sista resterna av den gamla kullen Somorrostro, som romarna valde som ursprunglig plats för den nuvarande staden. De exceptionella strategiska förhållandena, eftersom det var en udde som nästan helt omgavs av havet och från vilken hela bukten dominerades, var avgörande för den kontinuerliga mänskliga närvaron i denna enklav under hela medeltiden. När Santander fick jurisdiktion år 1187, under ledning av abboten i dess kyrka, inleddes en viktig ekonomisk utveckling som gjorde det möjligt att bygga den nuvarande katedralen och stadens slott på dess västra sida, befästa det som senare kallades Puebla Vieja och bygga nya murar för att försvara hela befolkningen och den aktiva hamnen.
