Sot Muzeu I Qytetit Të Brnos renditet midis muzeumeve më të larta në vend dhe është vendosur në disa nga ndërtesat historike, ikonike të qytetit: Kështjella Shpilberk, Malinska brana (Porta Malfin) dhe Vila Tugendhat. Shpilberk është vendi qendror, pasi mban administratën e muzeut, bibliotekat e tij, arkivën e tij të fotografive dhe shumicën e punonjësve specialistë të tij. Mjediset e kështjellës shërbejnë si një depozitë dhe një vend për ekspozita të përhershme si dhe shfaqje të tjera lidhur kryesisht me historinë dhe kulturën E Brno. Muzeu I Qytetit Brno administron Gjithashtu Vilën Tugendhat, një shembull i madh i arkitekturës moderne të renditur midis Vendeve Të Trashëgimisë Botërore të UNESKO-s.