Disempurnakan pada tahun 2001 oleh Kardinal Carlo Maria Martini, kepada siapa ia telah kemudian bernama pada tahun 2017, muzium adalah titik dari kedatangan yang penting projek yang paling besar angka Milanese ketua biskop abad kedua puluh telah memberi sumbangan penting. Asal-usulnya tarikh kembali ke yang pertama gerak hati Diberkati Ildefonso Schuster pada tahun 1931, kemudian diambil oleh Kardinal Montini pada tahun 1960 yang menunjukkan sebagai tempat baru muzium biara sant'eustorgio, salah satu yang penting tempat untuk sejarah Ambrosiana Kristian. Akhirnya, Kardinal Martini, di An, dipercayakan dengan tugas yang sukar untuk memulakan semula kerja Biara, rosak teruk dengan pengeboman Perang Dunia Kedua, dipercayakan kepada Belgiojoso studio.Pertama Dominican Biara di Milan terletak di sini, bermula di abad ketiga belas, dan dua Beranda, di mana Muzium Basilica sant'eustorgio dan Keuskupan Muzium adalah tengah, adalah apa yang tersisa dari yang kuno biara.
Tetap koleksi Keuskupan Muzium, yang menduduki kedua cloister, terdiri lebih dari seribu bekerja antara II dan XXI berabad-abad. Dari Uskup agung pejabat datang koleksi Milanese ketua biskop (bagian dari itu Terletak, Visconti, Riccardi, Pozzobonelli koleksi, dan lengkap Erba Odescalchi koleksi).
Di samping itu untuk lukisan dari gereja-gereja Keuskupan, museum memelihara penting kumpulan bekerja liturgi perabot. Koleksi selesai dengan bahagian khusus untuk emas dana (bekerja keempat Belas dan kelima belas abad, kebanyakannya Tuscan, dikumpulkan oleh Prof. Alberto Crespi dan menyumbangkan ke museum), serta ukiran dan lukisan dari koleksi Caterina Marcenaro, lukisan dari Sozzani koleksi dan berharga Schubert warisan.
Akhirnya, untuk pertama nukleus arca berfungsi dengan Lucio Fontana, ditambah banyak bekerja XX dan XXI berabad-abad, pengakuan minat museum untuk contemporaneity.
