Kisha është rezultat i aneksimit të disa strukturave arkitekturore: shkallët e dyfishta në fasadë fshehin hyrjen në kishën bazë të Consolation në Carbonara; Portali qendror të çon në Kapelën e Santa Monica, ajo në të majtë në hyrjen anësore të kishës së San Giovanni.Është një nga kishat më të pasura me vepra arti në qytet.Kisha e bukur u ndërtua falë një fisniku, Gualtiero Galeota i cili midis viteve 1339 dhe 1343 dhuroi tokën jashtë mureve të qytetit të quajtur "ad carbonetum" për Etërit Augustinianë, duke i lejuar ata të themelonin manastirin dhe kishën (Via Carbonara quhet të gjithë sot kështu-kështu sepse në mesjetë ishte një vend për grumbullimin e mbeturinave jashtë mureve të qytetit).Me ardhjen e mbretit Ladislaus të Durazzo-s në Napoli, filloi një rindërtim i plotë i kishës, e cila mori në thelb pamjen e saj aktuale, përveç disa modifikimeve dhe shtesave në shekujt në vijim. Hyrja e rëndësishme na bën të kuptojmë rëndësinë e kishës: aksesohet në të vërtetë përmes një shkalle monumentale të ndërtuar në shekullin e 18-të nga Ferdinando Sanfelice, i cili krijoi një shkallë me rampë të dyfishtë për të zgjidhur problemin e pabarazisë midis rrugës dhe hyrjeve të ndryshme. të ndërtesave të cilat formojnë strukturën komplekse arkitekturore.Në fakt, i gjithë kompleksi përfshin dy ndërtesa të tjera fetare, të cilat janë kisha e Santa Monikës dhe kisha e Consolazione në Carbonara; afër ka edhe një kishë tjetër, ajo e Pietatella në Carbonara. Brenda kishës monumentale të San Giovanni a Carbonara, e ndërtuar në një plan drejtkëndor, spikat mauzoleumi i mbretit Ladislao, i ndërtuar midis viteve 1414 dhe 1428 dhe plot figura alegorike.Pas monumentit është Cappella Caracciolo del Sole, me monumentin e Sergianni Caracciolo, seneshal i madh dhe dashnor i mbretëreshës Giovanna. Kapela të tjera, si ato të Miroballo, Somma dhe Caracciolo di Vico janë plot me statuja dhe monumente të rëndësishme varresh. Muret kanë afreske nga shkolla e Giottos që përfaqësojnë skena të jetës monastike dhe lindjes së Virgjëreshës. Në të djathtë të presbiterit janë Kapela Caracciolo di Vico, sakristia, altari i Madonna delle Grazie dhe monumenti funeral i Miroballo.Kisha përfshinte gjithashtu gjashtëmbëdhjetë vepra të Giorgio Vasarit, të krijuara për sakristinë e kishës. Pikturat në dru janë porositur në vitin 1545 me Urdhrin e Augustinianëve dhe janë realizuar nga Vasari në vitin 1546, me bashkëpunimin e Cristofano Gherardit, një prej bashkëpunëtorëve të tij më të mirë. Kishte 16 piktura në dru, të cilat zbukuronin dyert e dollapëve në sakristi që përshkruanin tregime nga Dhiata e Vjetër dhe Episode nga jeta e Pagëzorit. Punimet e bukura i janë nënshtruar një restaurimi rigoroz dhe janë ekspozuar edhe në Capodimonte.