Het klooster van San Francesco werd waarschijnlijk gesticht vóór 1301, toen de Minderbroeders met de bouw van de kerk begonnen. Het klooster bewaart een rijke collectie muzikale literatuur, terwijl de oude bibliotheek beschikt over een collectie boeken uit de vijftiende eeuw. Minderbroeders wonen nog steeds in het klooster, beheren de kerk, bieden geestelijke hulp en gastheren geestelijke retraites. Het klooster is een van de kamers met de beste akoestiek in Slovenië en sinds enkele jaren is het de thuisbasis van vele muzikale evenementen op hoog niveau, zoals de Piranesi muziekavonden en het Tartini Festival. Vanaf het klooster heeft u toegang tot de fotogalerij van het klooster waar u de werken van Venetiaanse schilders kunt bewonderen.