Andrea Doria se prisjeća kao jedan od najvažnijih članova obitelji, ako ne i najvažniji. Nakon njegove smrti, Montorsoli je bio zadužen za izgradnju kapetanove kripte, počašćen prestižnim naslovom "branitelj" za svoje postupke zaštite kršćanstva. Prostor je stavljen ispod oltara crkve. Da biste mu pristupili, spuštate se niz stepenice bijelog mramora, isti koji u potpunosti pokriva okoliš. U središtu je prinčeva grobnica, sarkofag na vrhu s dva anđela kako bi ga okružili punjenom. Bijeli mramor pokriva zidove kripte koja još uvijek sadrži lijes Andrea Doria.
