Liée à la figure de l'abbé Gioacchino da Fiore, l'abbaye a été construite après sa mort, entre 1215 et 1234, mais a réussi à garder intactes toutes les caractéristiques de l'architecture gioachimite. A partir de sa situation spatiale, dans un lieu isolé pour l'époque, mais dans le centre historique aujourd'hui, à plus de 1000 mètres d'altitude ; à l'utilisation de la ressource lithique locale et des travailleurs internes. En bref, tous les éléments qui se réfèrent au style de vie simple et austère du Saint, se retrouvent, entre autres, dans ses écrits, dans lesquels il présente les trois principales activités de l'homme : le travail manuel, la doctrine et la prière.
Le fait que toutes les églises aient presque la même structure, suggère l'existence d'une véritable école, avec son langage architectural. Celle de San Giovanni in Fiore, en particulier, a une seule nef, avec des murs nus, comme l'idéal de pauvreté était prédit ; l'autel est baroque et possède une statue en bois de Saint Jean-Baptiste, et les 4 rosaces derrière lui donnent une atmosphère surprenante avec un jeu d'ombre et de lumière ; en haut de l'escalier, à droite de l'autel, est conservée, dans la crypte, l'urne avec les restes de Gioacchino da Fiore, sur laquelle est gravé un verset dantesque qui lui est dédié : "...et éclairez-moi de côté, l'abbé calavrais Joachim, d'esprit prophétique doté." Les salles de l'abbaye abritent le Centre international d'études Gioachimiti depuis 1982, tandis que le rez-de-chaussée et le premier étage de l'aile est abritent l'un des musées ethnographiques les plus intéressants du sud de l'Italie : le Musée démologique d'économie, de travail et d'histoire sociale Silana, inauguré en 1984.
