All'interno della cattedrale, scoprite un eccezionale orologio astronomico costruito nel XIX secolo. L'orologio astronomico di Besançon si trova nella cattedrale dell'antica capitale francese dell'orologeria di Besançon. Fu realizzato dall'orologiaio Auguste-Lucien Vérité di Beauvais nel 1860 per sostituire un modello precedente realizzato da Bernardin negli anni '50 del XIX secolo.
È diverso dagli orologi astronomici di Beauvais, Lione e Strasburgo.
L'orologio esprime un concetto teologico che afferma che ogni secondo della giornata è rappresentativo della Resurrezione di Cristo, che ha trasformato l'esistenza dell'umanità e del mondo. Il primo orologio astronomico installato a Besançon è stato realizzato da un orologiaio di nome Bernardin. Questo orologio aveva smesso di funzionare nel 1857 e l'arcivescovo di Besançon, il cardinale Mathieu, ne commissionò uno sostitutivo a Vérité, che lavorò meticolosamente alla costruzione di una delle sue opere più belle nel suo laboratorio di Beauvais. L'orologio di Besançon fu installato nel 1860, ma Vérité continuò a lavorarci fino al 1863. È posizionato nelle proprie camere nella torre dell'orologio. Attraverso una disposizione di giunti universali che si estendono per oltre 100 metri, l'orologio aziona quattro quadranti che si trovano sui quattro lati della torre della cattedrale, fornendo così quattro posizioni per l'ora del giorno ai cittadini della città.c'è un quinto quadrante per l'ora del giorno nella cattedrale. I quadranti esterni indicano anche il mese dell'anno, il giorno della settimana e la stagione. Le ore del giorno sono segnate dal suono di una campana nella torre dell'orologio.