La Crypte napolitaine, également connue sous le nom de Vieille Grotte de Pouzzoles, a été construite à l'époque augustéenne par l'affranchi L. Cocceio Aucto, architecte d'Agrippa, amiral d'Octavien, selon Strabon (V, 4, 6) qui a également conçu le Portus Iulius, la "Grotte de Cocceio" et la Crypte romaine de Cuma. Mentionné dans la Tabula Peutingeriana (une carte avec les itinéraires routiers de la fin de l'âge impérial) et mentionné non seulement par Strabon mais aussi par Donato, Sénèque, Pétrone et Eusèbe, le tunnel est entièrement creusé dans le tuf sur une longueur de 705 m, une largeur originale de 4,50 m et une hauteur d'environ 5 m, éclairé et ventilé par deux puits de lumière obliques. La mauvaise visibilité à l'intérieur de la structure déjà pendant la vice-royauté espagnole a conduit à la construction d'un système d'éclairage constitué de lanternes soutenues par des cordes tendues entre des poteaux ; en 1806, avec Giuseppe Bonaparte, on a installé deux rangées de lanternes maintenues constamment allumées, tandis qu'à partir du milieu du XIXe siècle on a utilisé des lampes à gaz, dont l'une, à la fin du siècle, a été retrouvée lors de récents travaux de réaménagement. Suite aux travaux d'élargissement et d'abaissement du niveau de la rue, ainsi qu'au pavage réalisé en plusieurs étapes par Alphonse d'Aragon en 1455, par Don Pedro de Tolède en 1548, par Charles de Bourbon en 1748 et par la Ville de Naples en 1893, la grotte a perdu une grande partie de son aspect ancien. Sur les côtés de l'entrée, on trouve deux niches peintes à fresque : celle de gauche avec une représentation de la Vierge à l'Enfant datant du XIVe siècle, celle de droite avec le visage du Tout-Puissant de date incertaine. Pétrarque dans l'Itinerarium Syriacum rappelle une petite chapelle appelée Santa Maria dell'Idria, construite par un ermite juste à l'entrée de la grotte. Lors de la restauration aragonaise ou lors des travaux effectués à l'époque de la vice-royauté espagnole, un bas-relief en marbre blanc a été trouvé avec la représentation de Mithras datant de la fin du IIIe et du début du IVe siècle après J.-C., conservé au Musée archéologique national de Naples. La présence du dieu oriental Mithras est connue en Campanie dès le IIe siècle après J.-C., par opposition au christianisme de plus en plus répandu ; la présence du relief dans la Crypta a conduit à l'hypothèse que nous nous trouvons devant un lieu de culte mithriaque : la mithraea est généralement identifiée dans le spelaeum, la caverne cosmique, à l'intérieur de laquelle, depuis les plus anciennes preuves iconographiques, est représenté le sacrifice du taureau. Il est probable que les cultes mystérieux ont influencé la superstition populaire, qui a toujours associé quelque chose de mystérieux et de magique à la grotte, au point que la simple traversée de celle-ci sans dommage était considérée comme un véritable miracle.