Lacul Winnipeg (împreună cu Lacul Manitoba) sunt rămășițe ale lacului preistoric Agassiz din ultima epocă glaciară. Acel lac era atât de masiv încât a schimbat clima lumii și era mai mare decât cele cinci Mari Lacuri la un loc. A dispărut acum aproximativ 4.000 de ani.
Lacul Winnipeg este mare, dar este și relativ puțin adânc. Este al șaselea ca mărime lac de apă dulce din Canada și al treilea ca mărime care se află complet în Canada. Acesta găzduiește multe insule, dintre care majoritatea rămân nedezvoltate.
