Lake Winnipeg (samen met Lake Manitoba) zijn overblijfselen van het prehistorische Agassizmeer uit de laatste ijstijd. Dat meer was zo groot dat het het wereldklimaat veranderde en groter was dan de vijf Grote Meren samen. Het verdween ongeveer 4.000 jaar geleden.
Lake Winnipeg is groot, maar ook relatief ondiep. Het is het op zes na grootste zoetwatermeer van Canada en het op twee na grootste dat volledig in Canada ligt. Het is de thuisbasis van vele eilanden waarvan de meeste onontwikkeld blijven.
