Den andra versionen av madonnan är en oljemålning på pannå av Leonardo da Vinci, daterad till 1494-1508. Den första versionen av målningen är på Louvren. Confreres av den obefläckade uppfattningen om Maria av Milano beställde en målning för sitt altare i kyrkan San Francesco Maggiore till den unga konstnären Leonardo. Det mycket detaljerade kontraktet gav en komposition med Madonna mellan änglar, profeter och Gud Fadern, som vid ett ospecificerat ögonblick varierades av målaren och valde mötet mellan Jesus och Johannes i öknen, i närvaro av Maria och en ängel.