manastir he osnovao je Sveti Nishan (Sourb Nshan) u 10.veku za vreme vladavine kralja Abasa I. obližnji manastir u Sanahinu sagrađen je otprilike u isto vreme.
Mjesto manastira Haghpat izabrano je tako da gleda na Debed rijeku u regiji Lori sjeverne Armenije. Izgrađena je, ne na vrhuncu, već na pola brda na mjestu odabranom za zaštitu i prikrivanje od znatiželjnih očiju, kao i kao odgovor na neku vrstu monaške poniznosti. Vrh na suprotnoj strani rijeke visok je preko 2.500 metara.
Mala crkva Sv. Nishana je Haghpatova najranija preživjela zgrada. Počelo je 966-67. godine, a kasnije je uvećano i uljepšano pod vodstvom Trdata arhitekte.
Najveća crkva u kompleksu, Katedrala Svetog Nishana, sagrađena je od 967-991. To je tipičan primjer jermenske arhitekture iz desetog stoljeća, njegova središnja kupola počiva na četiri impozantna stupa bočnih zidova. Vanjski zidovi su prošarani trokutastim udubljenjima. Freska u apse prikazuje Hrista Pantokratora. Njegov donator, jermenski princ Khutulukhaga, prikazan je na južnom transeptu (transverzalna lađa koja siječe glavnu lađu). Sinovi osnivača crkve, knezovi Smbat i Kurike, prikazani su sa kraljicom Khosravanuche u bas-reljef na istoku zabat. Osim jedne ili dvije manje restauracije izvedene u jedanaestom i dvanaestom vijeku, crkva je zadržala svoj prvobitni karakter. Sahat-kula podignuta je 1210.godine i jedan je od najljepših primjera te vrste iz srednjovjekovnog perioda u Armeniji. Zvonik manastira, sagrađen 1245.godine, izdvaja se od glavne cjeline spomenika i arhitektonski je vrijedan pažnje.
Na teritoriji manastira stoji i niz prekrasnih khachkara (cross-stones) 11.-13. veka, najpoznatiji među njima je "Amenaprkich" (all-Savior) khachkar koji stoji od 1273. godine.
Manastir je oštećen mnogo puta. Negdje oko 1130. godine, zemljotres je uništio dijelove manastira Haghpat i obnovljen je tek pedeset godina kasnije. Takođe je pretrpeo brojne napade oružanih snaga u mnogim vekovima svog postojanja i od velikog zemljotresa u 1988-u. Ipak, veći dio kompleksa i dalje je netaknut i danas stoji bez značajnih promjena.
