În epoca Romană insula Patmos a fost un loc de exil și ucenic al lui Isus, St. John în 95 A. D. a fost pe insula, deoarece condamnat la exil de doi ani. Patmos este de fapt menționat în mod explicit în lucrare ca locul în care ar fi avut viziunile sale și ar fi scris Apocalipsa, ultima dintre cele 27 de cărți ale Noului Testament. Peștera Sfintei Ana, în care va avea loc acest lucru, este considerată ca fiind unul dintre cele mai importante locuri ale creștinătății. Și din acest motiv Patmos, este numit "Ierusalimul Mediteranei". Christopher în perioada arabă, în secolul al XI-lea și a fost numit apoi după Sfântul Ioan Teologul. Patmos era aproape pustiu când acest călugăr talentat și educat, San Cristodulo, în 1088, a cerut și a obținut conducerea întregii insule de la împăratul bizantin Alexios I Komnenos, pentru a întemeia o mănăstire în cinstea Sfântului Ioan Evanghelistul. San Cristodulo a rămas în Patmos până în 1108 când a fost forțat să-l abandoneze din cauza invaziilor piraților turci și a murit în același an în Euboea. Visul său, totuși, a continuat să inspire alți călugări care și-au continuat activitatea în secolele următoare și au extins Mănăstirea între secolele XV și XVII. Ioan Teologul a marcat începutul unei căi culturale și religioase care a condus insula să fie un punct de referință pentru tot creștinismul. Din acel moment a început o dezvoltare uimitoare pe insula Patmos, nu numai din punct de vedere cultural, ci și din punct de vedere economic. De-a lungul secolelor, în aproape un mileniu de istorie, Mănăstirea San Giovanni a rămas întotdeauna activă și păstrează fresce și documente antice de mare valoare. Insula Patmos a fost declarată sfântă de Patriarhie, de legea Sinodului și de legea 1155/81 a statului elen. Mănăstirea împreună cu orașul Chora și peștera Apocalipsei au fost numite de Patrimoniul Mondial Unesco în 1999, pentru valoarea lor universală ridicată. Mănăstirea, văzută din exterior, arată ca o cetate datorită zidurilor sale impunătoare de 15 metri înălțime. A fost construit pe cel mai înalt vârf din Patmos, cu ideea de a construi un loc bine apărat de pirați. La moartea călugărului, construcția zidurilor exterioare puternice ale bisericii principale (așa-numitul Catolicon) al mesei și unele dintre cele douăzeci de celule disponibile călugărilor de astăzi au fost finalizate. Interiorul mănăstirii are multe curți, mănăstiri și 10 capele. În curtea centrală, cu trei arcade mari construite în 1698, se află Katholikón, format din biserica principală, capela Sf. Capela dedicată Fecioarei are un plan dreptunghiular și găzduiește cele mai vechi fresce ale mănăstirii, datând de la sfârșitul secolului al XI-lea. În interiorul bisericii, cu un plan de cruce greacă și cupolă centrală, se află un iconostas din 1820 și câteva fresce din secolul al XVII-lea.