Masjid ini dibagi menjadi dua bagian: Bagian timur, yang disebut Beit al-Salah, didedikasikan untuk shalat. Sebagian dekorasinya bergaya Prancis, dengan ukiran kayu. Bagian barat, "Al-Sahn", adalah halaman besar yang menampung air mancur untuk wudhu dan menara jam tembaga berwarna kuning, hadiah dari Raja Louis-Philippe dari Perancis.
Di dalam tembok, terdapat banyak bangunan, termasuk tiga masjid dan sebuah istana. Sebagian besar dari mereka didirikan setelah kematian Saladin. Juga, sayangnya, banyak dari konstruksi asli dihancurkan pada tahun-tahun berikutnya dan digantikan oleh bangunan baru. Masjid Mohammed Ali: dibangun oleh Sultan Mohammed Ali Pasha, yang berkuasa pada tahun 1805. Masjid ini dikenal sebagai Masjid Alabaster, karena bahan ini mendominasi konstruksi gaya Barok Ottoman dan mengingatkan Agia Sofia di Istanbul, karena dirancang oleh insinyur yang sama. Dengan kubah setinggi 52 meter yang mengesankan, didukung oleh empat kolom, dan dua menara bergaya Turki, mendominasi lanskap kota dari bagian tertinggi Kairo. Ada empat kubah kecil di empat sudut masjid dan lebih dari 100 jendela kaca patri berwarna di dinding dan kubah yang memiliki efek indah pada interiornya.
Makam Muhammad Ali: berada di sebelah kanan pintu masuk masjid. Makam tiga tingkat ini dibangun dengan marmer putih dan didekorasi dengan indah dengan bunga-bunga yang dipahat dan dicat.