وينقسم المتحف اليهودي في بولونيا إلى ثلاثة أقسام: (أ) متحف دائم يعرض التاريخ القديم لليهود من العصور القديمة إلى الفترة المعاصرة ، مع الإشارة بشكل خاص إلى وجودهم في بولونيا وفي منطقة إميليا-رومانيا ؛ (ب) مساحة للمعارض والاجتماعات والمناقشات والأنشطة التعليمية المؤقتة للأطفال ، بما في ذلك المكتبة في عام 2001 ؛ (ج) مركز للتوثيق يضم مكتبة متخصصة تضم أكثر من 2000 مجلد ومحطات حاسوبية للزوار.