Ang kasaysayan ng Grotte di Nettuno ay nagmula pa noong sinaunang panahon. Ang ilang mga bakas, na kabilang sa Neolithic, na natagpuan sa loob ng mga ito, ay nagmumungkahi na mga 2,000,000 taon na ang lumipas mula nang mabuo ito. Halos tiyak na kilala sila ng mga primitive na lalaki at ginamit sila ayon sa kanilang mga pangangailangan.Ang mga Kuweba ng Neptune ay hindi lamang ang pinakatanyag kundi pati na rin ang pinakamalaki. Humigit-kumulang 4 na kilometro ang haba ng mga ito ngunit para sa mga kadahilanang pangkaligtasan ay maaari lamang ma-access ng mga turista ang bahagi ng mga ito. Bilang karagdagan sa kumakatawan sa isang mahalagang destinasyon ng turista at pagtanggap ng mga bisita mula sa buong mundo, ang Grotte di Nettuno ay isa ring destinasyon ng mahusay na atraksyon para sa mga speleologist, ang tanging makakabisita sa mga pinakalihim na bangin.