Bat sakon leku sakratua dela, kriptan aukeratu zen San Karlos Borromeo pertsonal bat bezala, otoitz leku bat, non joan zen behin, asteazken eta ostiral arratsaldean. Ez zen arraroa ikusi zion pasatzeko gau osoa zer egin zuen berak "izeneko gimnasioa Espiritu Santuaren," in adorazioa simulacrum Kristoren Hilobia. Hori dela-eta, ondoren, bere kanonizazioan, bat polychrome terrakota estatua irudikatzeko Saint belauniko aurrean sarkofago jarri zen.
Kriptan ere ahalbidetzen bisitari harremanetan zaharrenetako bat lekukotasun hiriaren historia. Zoladura du, osatua handi lauza harri zuri 'Verona', dator, hain zuzen ere, batetik zoladura antzinako Erromatar Foroaren laugarren mendean, plaza nagusian Erromatar civitas, non nagusietako zibil eta erlijio-jarduera guztiak hartu leku.
Berriro ireki publiko ondoren, berrogeita hamar urte 2016, gerora kriptan zen gaia konplexua zaharberritze eragiketa finantzatu MIBAC eta amaitu udaberri amaieran 2019, zuzenduta, batez ere, aldi berreskuratzeko apaindu gainazal. Esker zaharberritzea, izan ere, zoragarria fresko eta apaingarriak dute atzera, hala nola apaingarri zikloa izarrez eta landare-elementuen gangak presbiterioa, topaketak amaieran xiii. mendean. Leheneratu dira, halaber, bi eder eta bizia crucifixions (ko eskalan, get off, beste xiv. mendeko in presbiterioa), hiru zutik zifra maria Magdalena, Juan Bautista eta san. Helena, ama Konstantino (edo, agian, santa Caterina d'alessandria), The afaria Simon Etxea ezkerreko hegal presbiterioa, eta fresko Madonna Loreto eta Madonna eta Saints Rocco eta Juan Bautista lobby eta iztukuz eta apaingarriak xvii. mendean abside, irudikatuta dituzten tresnak pasioa.
