La mosaïque de sol de la cathédrale est de taille considérable, s'étendant sur toute la longueur de la nef principale, et se compose d'environ 600 000 tesselles polychromes de composition calcaire locale. Elle représente l'arbre de vie et a été commandée par l'évêque Gionata en 1163 et réalisée par le moine Pantaleone de l'abbaye de S. Nicola di Casale à Otranto, qui a achevé le chef-d'œuvre en 1165. Une première particularité de la mosaïque est le fait que le nom de son auteur y est gravé, en correspondance avec l'entrée principale, un fait pour le moins inhabituel pour l'époque et probablement dû au privilège de donner crédit à l'artiste en remerciement du splendide succès de l'œuvre. Comme nous l'avons mentionné, la signification que la plupart des experts donnent à la représentation est celle de l'arbre de vie, mais il existe des théories controversées et aucune conclusion n'a jamais été atteinte qui satisfasse toutes les écoles de pensée, laissant un voile de mystère autour de l'œuvre. Ce qui est clair, en revanche, c'est qu'autour de l'arbre, qui s'étend de l'entrée au presbytère, se déroulent une multitude de scènes de l'Ancien Testament, symbolisant le chemin tortueux emprunté par l'homme pour vaincre ses péchés et atteindre le salut éternel : les événements d'Adam et Eve, ceux de Caïn, d'Abel, la conception de l'enfer et du paradis. Les références mythologiques et historiques ne manquent pas, comme celles au roi Arthur et à Alexandre le Grand. La représentation des douze mois de l'année, à laquelle une partie circulaire est consacrée, ainsi que la représentation des travaux saisonniers relatifs sont également très frappantes. La richesse et la variété des éléments et des symboles présents sont une preuve supplémentaire de la manière dont Otrante a toujours représenté un point de rencontre entre les cultures, les peuples et les différents courants artistiques et culturels. La position géographique dont jouit la ville a facilité la rencontre et l'échange entre l'Occident et l'Orient, exposant souvent le lieu à des attaques et des invasions qui ont plus que favorisé, imposé leur propre culture. Après des millénaires d'histoire, ce qui reste est une série de trésors, d'empreintes, de signes du passage de différents peuples, qui ont enrichi les trésors d'Otrante aussi et surtout d'un point de vue artistique.