Moscheea este împărțită în două secțiuni: Cea estică, numită Beit al-Salah, este dedicată rugăciunii. O parte din decorul său este în stil francez, cu sculpturi în lemn. Secțiunea vestică, "Al-Sahn", este o curte mare care adăpostește fântâna pentru abluțiuni și un turn cu ceas din cupru galben, un cadou din partea regelui Ludovic-Filippe al Franței.
În interiorul zidurilor, există numeroase clădiri, inclusiv trei moschei și un palat. Cele mai multe dintre ele au fost ridicate după moartea lui Saladin. De asemenea, din păcate, multe dintre construcțiile originale au fost demolate în anii următori și înlocuite cu clădiri noi. Moscheea Mohammed Ali: a fost construită de sultanul Mohammed Ali Pașa, care a venit la putere în 1805. Este cunoscută sub numele de Moscheea de Alabastru, deoarece acest material predomină în construcția în stil baroc otoman și amintește de Agia Sofia din Istanbul, deoarece a fost proiectată de același inginer. Cu domul său impresionant de 52 de metri înălțime, susținut de patru coloane, și cele două minarete în stil turcesc, domină peisajul orașului din cea mai înaltă parte a Cairo. Există patru cupole mai mici în cele patru colțuri ale moscheii și peste 100 de vitralii colorate pe pereți și pe cupole, care au un efect frumos asupra interiorului.
Mormântul lui Mohammed Ali: se află în dreapta intrării în moschee. Mormântul cu trei niveluri a fost construit din marmură albă și este frumos decorat cu flori cizelate și pictate.