Det unikke museum er dedikeret til brødets 6.000-årige historie som et uundværligt grundlag for menneskets kultur og civilisation. Det skyldes Willy Eiselens (1896-1981) og hans søn Hermann Eiselens (født 1926) årtier lange personlige engagement, som har ført til dets oprettelse og udvikling. Begge beskæftigede sig med fremstilling og salg af bageriingredienser og var blandt de førende leverandører til bageribranchen.
De to iværksættere grundlagde i 1955 museet som det tyske brødmuseum i form af en forening. Den første permanente udstilling stammer fra 1960. Det var det første og i mange år det eneste museum af sin art i verden. Det var en strengt privat institution, der blev finansieret af stifterne. I 1991 blev finansieringen af museet overtaget af Eiselen Foundation, en uafhængig velgørende institution; samtidig flyttede museet ind i Salzstadel, en historisk lagerbygning i centrum af Ulm.
Her blomstrede museet, og i 2004 kunne det byde sin millionste besøgende velkommen.
