O Museo de San Gimignano atópase no antigo mosteiro de Santa Chiara, que antigamente foi usado como conservatorio para mozas de boa familia e máis tarde como escola secundaria. O conxunto foi sometido a obras de restauración entre os anos 80 e 90, transformándoo nun centro expositivo de grande interese. No interior do museo hai varias seccións, entre elas o Museo Arqueolóxico, a Santa Fina Spezieria e a Galería de Arte Moderna e Contemporánea "Raffaele De Grada".O Museo Arqueolóxico de San Gimignano alberga importantes testemuños que contan a historia máis antiga de San Gimignano, dende a época arcaica etrusca ata o século XVIII. A exposición divídese en dúas seccións: unha dedicada á arte etrusca e romana, con achados de asentamentos e necrópoles da zona, que datan dos séculos VII-I a.C.; o outro apartado está dedicado ás actividades produtivas artesanais, como o vidro e a cerámica, que estiveron presentes na cidade durante a Idade Media.A Spezieria di Santa Fina está anexa ao hospital do mesmo nome, fundado a mediados do século XIII. A exposición presenta mobiliario e accesorios das antigas institucións sanitarias da cidade. O deseño recrea o ambiente e os aromas orixinais da farmacia, unha das máis antigas da Toscana. Os produtos estaban contidos en recipientes de cerámica e vidro de alta calidade, que databan do século XV ao XVIII. O itinerario expositivo percorre a historia dos medicamentos e das actividades relacionadas co traballo do boticario. Tamén se exhiben unha serie de medicamentos antigos, como o aceite de escorpións e os compoñentes empregados na elaboración de medicamentos.A Galería de Arte Moderna e Contemporánea "Raffaele De Grada" leva o nome do coñecido pintor milanés Raffaele De Grada. O artista escolleu San Gimignano como a súa casa preferida despois de viaxar por toda Europa. A galería exhibe moitas obras de De Grada e doutros artistas dos séculos XIX e XX. A colección permanente inclúe obras do século XIX e do XX da Toscana. Tamén hai dúas salas monográficas dedicadas a Niccolò Cannicci e Raffaele De Grada, así como obras de Giannetto Fieschi. A galería tamén está enriquecida con pinturas italianas desde os anos 30 ata os 80 da Colección Pacchiani.A Galería de Arte Moderna e Contemporánea representa o espazo expositivo máis importante de San Gimignano, onde se organizan frecuentes exposicións temporais dedicadas á arte do XIX, XX e contemporánea.