Ang Museo ng San Gimignano ay matatagpuan sa sinaunang monasteryo ng Santa Chiara, na noong nakaraan ay ginamit bilang isang konserbatoryo para sa mga kabataang babae ng mabubuting pamilya at kalaunan bilang isang middle school. Ang complex ay sumailalim sa restoration work sa pagitan ng 1980s at 1990s, na ginawa itong isang exhibition center na may malaking interes. Sa loob ng museo mayroong ilang mga seksyon, kabilang ang Archaeological Museum, ang Santa Fina Spezieria at ang "Raffaele De Grada" Modern and Contemporary Art Gallery.Ang Archaeological Museum of San Gimignano ay naglalaman ng mahahalagang patotoo na nagsasabi sa pinaka sinaunang kasaysayan ng San Gimignano, mula sa sinaunang panahon ng Etruscan hanggang sa ikalabing walong siglo. Ang eksibisyon ay nahahati sa dalawang seksyon: ang isa ay nakatuon sa Etruscan at Romanong sining, na may mga nahanap mula sa mga pamayanan at necropolises sa lugar, na itinayo noong ika-7-1 siglo BC; ang iba pang seksyon ay nakatuon sa artisanal na produktibong aktibidad, tulad ng salamin at keramika, na naroroon sa lungsod noong Middle Ages.Ang Spezieria di Santa Fina ay nakadugtong sa ospital na may parehong pangalan, na itinatag noong kalagitnaan ng ika-13 siglo. Ang eksibisyon ay nagtatanghal ng mga kasangkapan at kasangkapan mula sa mga sinaunang institusyong pangkalusugan ng lungsod. Nililikha ng layout ang kapaligiran at ang mga orihinal na aroma ng parmasya, isa sa pinakamatanda sa Tuscany. Ang mga produkto ay nakapaloob sa mga de-kalidad na ceramic at glass vessel, mula noong ika-15 hanggang ika-18 siglo. Sinusubaybayan ng itinerary ng eksibisyon ang kasaysayan ng mga gamot at ng mga aktibidad na nauugnay sa gawain ng apothecary. Nakadisplay din ang ilang mga sinaunang gamot, tulad ng langis ng mga alakdan at mga sangkap na ginagamit sa paghahanda ng mga gamot.Ang "Raffaele De Grada" Modern and Contemporary Art Gallery ay ipinangalan sa kilalang Milanese na pintor na si Raffaele De Grada. Pinili ng pintor ang San Gimignano bilang kanyang tahanan na pinili pagkatapos maglakbay sa buong Europa. Ang gallery ay nagpapakita ng maraming mga gawa ni De Grada at iba pang 19th at 20th century artists. Kasama sa permanenteng koleksyon ang mga gawa mula sa Tuscan 19th century at 20th century. Mayroon ding dalawang monographic room na nakatuon sa Niccolò Cannicci at Raffaele De Grada, pati na rin sa mga gawa ni Giannetto Fieschi. Ang gallery ay pinayaman din ng mga Italian painting mula 1930s hanggang 1980s mula sa Pacchiani Collection.Ang Gallery of Modern and Contemporary Art ay kumakatawan sa pinakamahalagang exhibition space sa San Gimignano, kung saan ang mga madalas na pansamantalang exhibition na nakatuon sa ika-19, ika-20 at kontemporaryong sining ay inorganisa.