El Museu del Bolet de San Sisto recull més de dos-cents guix soques de reproducció de les espècies més comunes entre els bolets del territori de Montefeltro. L'estructura ha estat reforçada amb la xarxa d'equips informàtics capaços de connectar-se a multimèdia bases de dades sobre el patrimoni natural de la província de Pesaro i Urbino i de la Micologia en general. La biblioteca multimèdia, consistent en un arxiu de CD-Rom relatiu a científic i naturalista temes, està a disposició dels visitants del Centre per a consulta.
El museu es completa amb una sala de conferències amb una quarantena de places, equipats per a reunions científiques i debats, i un laboratori de medi ambient d'experiències docents.